Une étude révèle une réduction de la diversité microbienne dans les intestins des ours sauvages qui mangent de la nourriture humaine –

“Nous savons qu’un régime” occidental “peut réduire la diversité microbienne dans les intestins des humains, des souris et d’autres espèces, ce qui peut avoir un effet néfaste sur leur santé”, a déclaré Erin McKenney, co-auteur de l’étude et professeure adjointe en sciences appliquées. l’écologie à l’état NC. “Nous voulons savoir si la même chose est vraie pour la faune, en particulier compte tenu du chevauchement croissant entre l’endroit où les gens vivent et où vit la faune. Une possibilité que notre travail soulève ici est que si la faune commence à consommer des aliments humains, cela peut affecter leur capacité à dériver comme beaucoup de nutrition de leur régime alimentaire traditionnel et sauvage s’ils cessent de manger des aliments humains. »

“Une étape pour voir si la même chose est vraie pour la faune est d’évaluer l’impact que les aliments humains ont sur le microbiome intestinal des mammifères sauvages”, explique Sierra Gillman, premier auteur de l’étude et titulaire d’un doctorat. étudiant à l’Université de Washington. “Dans cette étude particulière, nous voulions savoir comment les aliments humains influencent le microbiome intestinal des ours noirs.” Gillman a fait le travail alors qu’il était étudiant diplômé à NMU.

Les chercheurs ont concentré l’étude sur le Michigan, qui permet aux chasseurs d’« appâter » les ours en laissant de côté de grandes quantités de nourriture humaine, comme des céréales sucrées et des bonbons. Les chasseurs appâteront des sites spécifiques pendant des semaines ou des mois pour attirer régulièrement les ours dans une zone spécifique. En conséquence, certains ours ont une alimentation riche en malbouffe humaine pendant une période prolongée.

Pour collecter des échantillons de la population d’ours sauvages, les chercheurs ont travaillé avec des guides qui dirigent des voyages programmés avec des chasseurs dans la péninsule supérieure du Michigan. Les guides ont collecté des échantillons d’ours qui ont été récoltés lors de leurs voyages réguliers avec les chasseurs. Plus précisément, les guides ont suivi un protocole détaillé pour récupérer des échantillons de cheveux et deux échantillons d’intestin. Les échantillons d’intestin provenaient du jéjunum, qui est la partie médiane de l’intestin grêle, et du côlon, également appelé gros intestin. En fin de compte, les chercheurs ont pu récupérer des échantillons de 35 ours récoltés légalement.

Les chercheurs ont traité les échantillons intestinaux pour identifier à la fois les types de microbes présents dans le microbiome de chaque ours ainsi que le nombre de chaque type de microbe présent.

Les chercheurs ont également effectué une analyse isotopique du carbone des poils de l’ours, ce qui leur a permis d’évaluer le régime alimentaire à long terme de chaque ours. Plus précisément, l’analyse a indiqué aux chercheurs dans quelle mesure chaque ours consommait du sucre et du maïs, qui sont plus susceptibles d’être trouvés dans les aliments transformés.

Lors de l’analyse des données, les chercheurs ont examiné deux mesures de la biodiversité intestinale. Ils examinent d’abord le nombre total d’espèces différentes présentes. Deuxièmement, ils ont examiné une mesure appelée diversité phylogénétique de Faith, qui examine le nombre de types différents d’espèces présentes.

“Fondamentalement, la diversité phylogénétique de Faith évalue le nombre de branches de l’arbre généalogique bactérien représentées”, explique Gillman.

Les deux mesures de la biodiversité intestinale étaient considérablement plus faibles chez les ours qui avaient mangé plus d’aliments transformés.

“Essentiellement, nous avons constaté que plus les ours noirs mangent de nourriture humaine, et plus ils en mangent longtemps, moins leurs microbiomes intestinaux sont diversifiés”, explique Gillman.

“Le sucre est très facile à digérer”, dit McKenney. “Beaucoup de bactéries peuvent le consommer. En termes pratiques, cela signifie que les aliments humains transformés ont en fait moins nourriture disponible pour les bactéries spécialisées dans la dégradation des fibres ou d’autres glucides microaccessibles. Ces spécialistes des bactéries ont du mal à rivaliser avec les autres bactéries pour le sucre, et leur niche dans le réseau trophique n’est pas durable si les ours ne mangent pas assez de leur alimentation traditionnelle. Nous pensons que c’est l’un des mécanismes de réduction de la microdiversité intestinale.

“Et si la biodiversité intestinale souffre lorsque les ours commencent à consommer plus de nourriture humaine, cela soulève la possibilité qu’il serait plus difficile pour les ours de tirer autant de valeur nutritionnelle des aliments non humains s’ils retournent à un régime” sauvage “”, McKenney dit. “Fondamentalement, on ne sait pas à quelle vitesse les espèces microbiennes qui décomposent les fibres, etc., reviendraient.”

“Maintenant que nous avons identifié cette association entre la consommation d’aliments humains et la biodiversité microbienne, nous devons faire des travaux supplémentaires pour déterminer ce que cela signifie pour la santé de ces animaux – et potentiellement d’autres animaux”, a déclaré Gillman.

“De nombreux chasseurs utilisent des pièges photographiques pour surveiller leurs sites d’appâts, et les personnes avec qui nous avons travaillé nous ont dit qu’ils voyaient une grande variété d’espèces – ratons laveurs, pêcheurs, martres, cerfs, lièvres – manger l’appât à ours”, explique Diana Lafferty, co-auteur de l’article et professeure adjointe d’écologie de la faune à la NMU.

« On ne sait pas exactement comment les appâts pourraient affecter les microbiomes ou la santé d’autres espèces sauvages qui profitent de la nourriture gratuite. Alors que nous pensons à la conservation, l’évaluation de l’impact de nos activités sur la diversité peut devoir s’étendre à la protection de la diversité microbienne. Les preuves suggèrent de plus en plus que bon nombre de ces organismes microbiens sont essentiels à la santé des espèces sauvages. Comment les appâts s’intègrent-ils là-dedans ? Ce sont des questions que je pense que nous devrons explorer. “

L’article, “Les aliments fournis par l’homme réduisent la diversité du microbiome intestinal chez les ours noirs américains (Ursus américain)” est publié dans le Journal de Mammalogie.

Le travail a été réalisé avec le soutien de la National Science Foundation, sous la subvention 1000263298; et de Sigma Xi, la Scientific Research Honor Society, sous la subvention G2018100198233997.