Lorsque l’écosystème interne de l’intestin se dérègle, un traitement ancien mais grossier pourrait-il y remédier ? Des chercheurs sur les lémuriens plaident en faveur de greffes fécales pour réduire les effets secondaires des antibiotiques –

Le Dr Cathy Williams savait que quelque chose n’allait pas. La vétérinaire s’était sentie mal pendant des semaines après son voyage de 2014 à Madagascar.
Au début, elle se sentait simplement ballonnée et mal à l’aise et n’était pas intéressée à manger beaucoup. Mais finalement, elle a développé une fièvre et des frissons qui l’ont envoyée aux urgences.
Lors des tests, les médecins ont découvert que ce qu’elle avait n’était pas seulement un problème d’estomac. Elle souffrait d’une infection Clostridium difficile, un germe qui provoque une diarrhée sévère et des douleurs abdominales et peut rapidement devenir mortel s’il n’est pas traité rapidement.
“C’était horrible”, a déclaré Williams.
La condition est souvent déclenchée lorsque les antibiotiques perturbent l’équilibre normal des bactéries qui habitent l’intestin, permettant aux “mauvaises” bactéries telles que C. difficile se multiplier sans contrôle et faire des ravages dans les intestins.
Pour maîtriser son infection, Williams a demandé à ses médecins s’ils pouvaient essayer une approche qu’elle et d’autres vétérinaires utilisaient depuis des décennies pour traiter les lémuriens souffrant de problèmes digestifs au Duke Lemur Center. La procédure, connue sous le nom de greffe de microbiote fécal, consiste à prélever les selles d’un donneur sain et à les administrer au patient pour ajouter de « bons » microbes et réinitialiser l’intestin.
À l’époque, il était considéré comme trop expérimental pour une utilisation clinique dans des cas humains comme celui de Williams. On lui a prescrit le traitement standard et on l’a renvoyée de l’hôpital chez elle, bien qu’elle ne se sente pas assez bien pour retourner travailler pendant un mois de plus. Mais maintenant, de nouvelles recherches sur les lémuriens confirment ce que Williams et d’autres soupçonnaient depuis longtemps : que ce traitement ancien, mais grossier, peut aider un microbiome intestinal déséquilibré à revenir à la normale.
Dans une étude récente de la revue Microbiome animal, une équipe de recherche dirigée par le professeur Duke Christine Drea, l’ancienne doctorante Sally Bornbusch et ses collègues ont examiné les microbiomes intestinaux de 11 lémurs catta en bonne santé sur une période de quatre mois après avoir reçu une cure de sept jours de l’antibiotique à large spectre amoxicilline .
Les lémuriens ont été divisés en deux groupes expérimentaux. L’un était un groupe d’attente, avec un suivi continu mais aucun autre traitement après les antibiotiques. L’autre groupe a reçu une bouillie de ses propres excréments, collectée avant le traitement antibiotique, puis mélangée à une solution saline et réinjectée au même animal après la fin de son traitement antibiotique.
“Cela semble fou”, a déclaré Williams. Mais elle a utilisé une procédure similaire depuis les années 1990 pour traiter les maladies des lémuriens sifaka de Coquerel, dont les nourrissons sont connus pour manger le caca de leur mère pendant le sevrage – vraisemblablement pour obtenir les microbes dont ils auront besoin pour passer à la nourriture solide.
Drea, Bornbusch et leur équipe ont utilisé des techniques de séquençage génétique pour suivre les changements dans le microbiome intestinal des lémuriens avant, pendant et après le traitement.
Comme prévu, même une seule cure d’antibiotiques a fait chuter le nombre de microbes dans leurs intestins par rapport aux témoins, effaçant brièvement la diversité des espèces dans les deux groupes expérimentaux avant de revenir à la ligne de base.
“Les antibiotiques ont eu des effets dramatiques, même chez les animaux en bonne santé”, a déclaré Drea.
Mais en termes de types de bactéries qui ont rebondi et à quel moment, les schémas de récupération dans les deux groupes étaient différents. Les lémuriens qui ont reçu le traitement de “soupe de caca” ont commencé à se stabiliser et à retrouver leur microbiome pré-antibiotique en environ deux semaines. En revanche, la composition bactérienne dans le groupe d’attente a continué à fluctuer et n’était toujours pas tout à fait revenue à la normale même après quatre mois d’observation.
Ce type de thérapie n’est pas nouveau. Des rapports sur l’utilisation de greffes fécales pour traiter les personnes souffrant d’intoxication alimentaire ou de diarrhée remontent au IVe siècle en Chine. Les preuves de son efficacité en captivité ont poussé Bornbusch à préconiser la congélation des selles au zoo national de Smithsonian, où elle est maintenant boursière postdoctorale.
“Si nous pouvons stocker les excréments d’animaux lorsqu’ils sont en bonne santé, cela peut être un énorme avantage sur la route”, a déclaré Bornbusch. “Cela peut aider les animaux à aller mieux, plus rapidement.”
Et maintenant, si l’un de ses patients lémuriens tombait malade C. difficile comme elle l’a fait, Williams a déclaré: “Je choisirais absolument une greffe de microbiote fécal.”
“Les gens sont rebutés par cela”, a déclaré Drea, “Mais le dégoût pour cette approche pourrait en fait avoir retardé un remède assez bon marché et utile.”
Cette recherche a été soutenue par la National Science Foundation (BCS 1749465), le Duke Lemur Center Director’s Fund et le Duke Microbiome Center.
Source de l’histoire :
Matériaux fourni par université de Duke. Original écrit par Robin Smith. Remarque : Le contenu peut être modifié pour le style et la longueur.