L’ancienne main de Néandertal dans le COVID-19 sévère –


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  • Depuis son apparition à la fin de 2019, le nouveau virus, le SRAS-CoV-2, a eu une gamme d’impacts sur ceux qu’il infecte. Certaines personnes tombent gravement malades avec le COVID-19, la maladie causée par le virus, et doivent être hospitalisées, tandis que d’autres présentent des symptômes bénins ou sont même asymptomatiques.

    Il existe plusieurs facteurs qui influencent la susceptibilité d’une personne à avoir une réaction sévère, comme son âge et l’existence d’autres conditions médicales. Mais la génétique joue également un rôle et, au cours des derniers mois, des recherches de la COVID-19 Host Genetics Initiative ont montré que les variantes génétiques dans une région du chromosome 3 imposent un risque plus grand que leurs porteurs développent une forme sévère du maladie.

    Maintenant, une nouvelle étude, publiée dans La nature, a révélé que cette région génétique est presque identique à celle d’un néandertalien de 50 000 ans du sud de l’Europe. Une analyse plus approfondie a montré que, grâce au métissage, les variantes sont venues aux ancêtres des humains modernes il y a environ 60 000 ans.

    “Il est frappant que le patrimoine génétique des Néandertaliens ait des conséquences si tragiques pendant la pandémie actuelle”, a déclaré le professeur Svante Pääbo, qui dirige l’unité de génomique évolutive humaine à l’Okinawa Institute of Science and Technology Graduate University (OIST).

    Le COVID-19 grave est-il écrit dans nos gènes?

    Les chromosomes sont de minuscules structures qui se trouvent dans le noyau des cellules et portent le matériel génétique d’un organisme. Ils viennent par paires avec un chromosome dans chaque paire hérité de chaque parent. Les humains ont 23 de ces paires. Ainsi, 46 chromosomes portent l’intégralité de notre ADN – des millions et des millions de paires de bases. Et bien que la grande majorité soit la même entre les personnes, des mutations se produisent et des variations persistent au niveau de l’ADN.

    La recherche de l’Initiative de génétique de l’hôte COVID-19 a porté sur plus de 3000 personnes, y compris à la fois des personnes hospitalisées pour un COVID-19 sévère et des personnes infectées par le virus mais qui n’ont pas été hospitalisées. Il a identifié une région sur le chromosome 3 qui détermine si une personne infectée par le virus deviendra gravement malade et devra être hospitalisée.

    La région génétique identifiée est très longue, couvrant 49400 paires de bases, et les variantes qui imposent un risque plus élevé de COVID-19 sévère sont fortement liées – si une personne a l’une des variantes, elle est très susceptible d’avoir les treize d’eux. Des variantes comme celles-ci se sont précédemment avérées provenir de Néandertaliens ou de Denisoviens, alors le professeur Pääbo, en collaboration avec le professeur Hugo Zeberg, premier auteur de l’article et chercheur à l’Institut Max Planck d’anthropologie évolutive et à l’Institut Karolinska, a décidé d’enquêter sur la question de savoir si c’était l’affaire.

    Ils ont découvert qu’un Néandertalien du sud de l’Europe portait une région génétique presque identique, contrairement à deux Néandertaliens du sud de la Sibérie et un Denisovan.

    Ensuite, ils se sont demandé si les variantes venaient des Néandertaliens ou avaient été héritées à la fois par les Néandertaliens et les gens d’aujourd’hui par un ancêtre commun.

    Si les variantes provenaient de croisements entre les deux groupes de personnes, cela se serait produit il y a à peine 50 000 ans. Alors que, si les variantes venaient du dernier ancêtre commun, elles auraient existé chez les humains modernes depuis environ 550 000 ans. Mais des mutations génétiques aléatoires et des recombinaisons entre chromosomes se seraient également produites pendant cette période et parce que les variantes entre les Néandertaliens du sud de l’Europe et les gens d’aujourd’hui sont si similaires sur une si longue étendue d’ADN, les chercheurs ont montré que c’était beaucoup plus probablement qu’ils provenaient de croisements.

    Le professeur Pääbo et le professeur Zeberg ont conclu que les Néandertaliens apparentés à celui du sud de l’Europe ont fourni cette région d’ADN aux personnes d’aujourd’hui il y a environ 60 000 ans, lorsque les deux groupes se sont rencontrés.

    Les variantes de Néandertal présentent jusqu’à trois fois le risque

    Le professeur Zeberg a expliqué que ceux qui portent ces variantes de Néandertal ont jusqu’à trois fois le risque de nécessiter une ventilation mécanique. “De toute évidence, des facteurs tels que votre âge et d’autres maladies que vous pourriez avoir affectent également la gravité de votre maladie. Mais parmi les facteurs génétiques, c’est le plus fort.”

    Les chercheurs ont également constaté qu’il existe des différences majeures dans la fréquence de ces variantes dans différentes parties du monde. En Asie du Sud, environ 50% de la population en porte. Cependant, en Asie de l’Est, ils sont presque absents.

    On ne sait pas encore pourquoi la région génique de Néandertal est associée à un risque accru de devenir gravement malade. “C’est quelque chose que nous et d’autres étudions maintenant aussi rapidement que possible”, a déclaré le professeur Pääbo.

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